継体天皇三年（西暦509年）四月、物部氏の勧請により当目山に鎮斎、その後一度海中神の岩に鎮座したが、風浪の害を避けて現在地に奉遷された。

我が国の最も古い神祭の姿である、海の彼方から訪れる神を、一旦海中の島（神の岩）にお迎えし、海岸の御座穴にお祭りし、

さらに姿美しい神奈美山（かんなびやま＝お椀を伏せたような姿の山）に神は降臨されるという、その信仰そのままの山が当目山であった。

したがって、その昔は社殿もなく、山そのものが御本殿（御神座）であった。

延喜式内社で、『延喜式』（西暦927年完成）巻九神名上に「駿河国益津郡四座並小、那閉神社」とある。

昔は年々国司が祭り、弘安四年（西暦1281年）には朝廷より奉幣があった。

現在も大漁神・福神として近郷の崇敬を集めている。

旧除地は二石で明治八年（西暦1875年）二月村社に、同四十年（西暦1907年）三月神饌幣帛料供進社に、大正四年（西暦1915年）五月四日に郷社に列格した。

以前は旧二月十四日に行われていたが、今は二月初午に末社稲荷神社の祭典と合わせ行われている。

漁業者の大漁祈願祭で、以前は鰹・鮪が山のように供えられ、四斗樽の鏡がぬかれ、たいへんな賑わいであった。

浦祭の「浦」は、もともと占いの「ウラ」で、大漁を占う祭りであった。